Les usages de substances biocides en ville sont nombreux, conduisant à la contamination des eaux urbaines et, par conséquent, à des rejets vers le milieu récepteur. Cette étude propose une approche indirecte pour mettre en évidence ces apports urbains de biocides, en échantillonnant et analysant les eaux de surface en amont et en aval de l'agglomération parisienne. La plupart des substances ciblées ont été systématiquement quantifiées sur tous les sites, avec un dépassement fréquent de la concentration prédite sans effet pour les benzalkoniums. Les biocides véhiculés principalement par les eaux pluviales (en raison de leur utilisation sur/dans les matériaux du bâti et de leur lessivage par temps de pluie) présentaient des concentrations plus élevées dans les rivières pendant ou après une période de pluie ; à l’inverse, aucune différence n'était visible entre temps sec et temps de pluie pour les substances véhiculées principalement par les eaux usées. Les flux de biocides dans la Seine ont été estimés entre quelques dizaines de grammes par jour et plusieurs kilogrammes par jour selon le composé. Pour plusieurs molécules, une augmentation significative des flux journaliers a été observée entre les sites amont et aval. Dans le cas de la benzisothiazolinone, cette augmentation est du même ordre de grandeur que le flux moyen rejeté par les deux stations d'épuration de la zone d'étude. Ce travail d'identification des principales voies d’introduction des biocides urbains dans les eaux de surface constitue une première étape vers la mise en œuvre de solutions d'atténuation efficaces et concertées.